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9月15日,國家衛生健康委員會發布公告稱,考慮到猴痘疫情將在我國一定時期內持續存在,為進一步科學規范開展猴痘疫情防控工作,切實保障人民群眾生命安全和身體健康,國家衛生健康委決定,自2023年9月20日起將猴痘納入《中華人民共和國傳染病防治法》規定的乙類傳染病進行管理,采取乙類傳染病的預防、控制措施。
根據中國疾控中心公布的數據,3個月內,中國內地本土猴痘病例累計已經超過千例。《中華人民共和國傳染病防治法》規定,疾病預防控制機構應當主動收集、分析、調查、核實傳染病疫情信息,接到乙類傳染病疫情報告或者發現傳染病暴發、流行時,應當立即報告當地衛生行政部門,由當地衛生行政部門立即報告當地人民政府,同時報告上級衛生行政部門和國務院衛生行政部門。
為了助力疾控系統提升應急溯源能力,華大智造已經為各級疾控中心提供了可實現猴痘病毒快速鑒定及溯源的病原微生物靶向測序產品組合,相關設備及產品已投入運營。
內地首例后,華大智造再助力深圳疾控
完成深圳首例猴痘病例病毒溯源
今年6月,深圳市疾病預防控制中心(簡稱深圳疾控)基于華大智造病原微生物靶向測序產品組合完成深圳首例猴痘病例病毒溯源,相關文章被Biosafety and Health雜志接收并于8月發表。

截圖自Biosafety and Health雜志
6月8日22時整,深圳市疾病預防控制中心接到福田區疾控中心通報的一例猴痘疑似病例,并立即抽調人員開展流行病學調查,收集了大量樣本用于猴痘病毒的分子檢測和病毒測序。
該次溯源采用華大智造ATOPlex多重PCR技術開發的猴痘病毒靶向測序Panel對猴痘病毒基因組富集及測序文庫的構建,建庫流程搭配了MGISP-960高通量自動化樣本制備系統,實現了高效自動的實驗流程。使用一步法制備DNA 納米球 (DNB),而后在DNBSEQ-G99測序儀上對 DNB 文庫進行測序,并使用華大智造MPXV軟件包對測序數據進行了分析,從而確定突變位點、共有序列和猴痘病毒譜系,最終在短時間內得到了高度可信的毒株序列全長。
研究人員通過基因組測序的Nextclade分析(https://clades.nextstrain.org/),確定了深圳三例病例均感染了人類猴痘病毒(hMpxV,B.1.3進化分支)。對已識別的猴痘病毒進行進一步的溯源研究,研究人員對全球所有B.1.3基因序列進行了系統發育樹分析,發現深圳和杭州的四個本地病例與最近許多日本猴痘病例處于同一進化分支上。從進化的角度來看,這四個中國病例與2023年1月、2月和3月收集的日本株系(GISAID ID: EPI_ISL_17445514,EPI_ISL_17445515,EPI_ISL_17692269)高度同源。

中國深圳發現的3個MPXV的系統發育樹,45個MPXV(樣本采集時間為2023年1月1日至2023年7月3日)下載于GISAID
快速、精準,華大智造病原微生物靶向測序產品組合
為猴痘監測“一錘定音”
此前,華大智造于2022年9月助力中國疾控中心完成內地首例輸入性猴痘病例病毒溯源,該次溯源基于華大智造當時剛發布的最新款基因測序儀DNBSEQ-G99等設備進行全基因組測序,在短時間內得到了高度可信的毒株序列全長。
為進一步提升猴痘病毒溯源工作的效率,華大智造推出病原微生物靶向測序產品組合,基于ATOPlex多重PCR技術開發了猴痘病毒靶向測序Panel,含739重PCR引物,覆蓋病毒全長基因組,可對病毒進行相對定量,搭配華大智造DNBSEQ測序平臺和MPXV分析軟件以及MGISP-100或MGISP-960高通量自動化樣本制備系統,實現從樣本到報告的全流程支持,具有數據質量優異、基因組覆蓋全、自動化程度高等特點,為猴痘病毒的監測與溯源提供強大工具。
ATOPlex多重PCR 技術,是華大智造自主研發的超高重 PCR 核心專利技術,可針對目標區域進行引物設計,并提供Panel和建庫試劑等一整套方案,實現精準高效的病原微生物靶向測序。除此之外,該技術平臺還可應用于司法、農業、腫瘤等多個領域,提供全面、專業的靶向測序產品。

華大智造病原微生物靶向測序產品組合
華大智造設備與軟件在猴痘病毒監測應用中已經積累了一定的實踐基礎,成功助力中國疾控中心、地方疾控等多個公共衛生機構對猴痘病毒進行病毒識別與溯源。面對不斷產生的疫情挑戰,華大智造始終秉承“創新智造引領生命科技”的理念,持續提升技術平臺和核心產品,致力于滿足病原微生物全基因組測序、靶向測序和宏基因組測序全流程等應用場景的需求,為傳感染病的監測和預警提供更自動、更便捷、更高效的核心工具。
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