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公共衛(wèi)生

高通量測序技術(shù)助力
公共衛(wèi)生的研究與應(yīng)用

公共衛(wèi)生事件，主要包括傳染病疫情，群體性不明原因疾病，食品安全和職業(yè)危害，動(dòng)物疫情，以及其他嚴(yán)重影響公眾健康和生命安全的事件。基因組學(xué)研究為流行病的預(yù)防監(jiān)測提供了重要的科學(xué)依據(jù)，已成為公共衛(wèi)生工作者識(shí)別新發(fā)病原、監(jiān)測疫情變化的重要工具，同時(shí)也在病原微生物的耐藥機(jī)制研究以及疫苗研制等方面得到了廣泛的應(yīng)用。

公共衛(wèi)生安全不僅關(guān)注人類健康，同時(shí)也聚焦動(dòng)物、植物、環(huán)境乃至他們共同構(gòu)成的生態(tài)間的交互關(guān)系。實(shí)現(xiàn)同一健康（One Health）理念需要通過跨學(xué)科的研究方法，而基因組學(xué)是實(shí)現(xiàn)這些的強(qiáng)大工具，幫助更好地從整體上理解生態(tài)系統(tǒng)中的健康狀況 [1]。

在公共衛(wèi)生領(lǐng)域，華大智造已形成病原微生物宏基因組測序、靶向測序、全基因組測序等應(yīng)用場景的全流程產(chǎn)品組合。基于ATOPlex多重PCR建庫平臺(tái)，華大智造已推出可用于監(jiān)測新冠病毒、登革病毒1~4型、猴痘病毒、甲型/乙型流感病毒、HIV-1以及結(jié)核分枝桿菌等多款靶向測序全流程測序組合產(chǎn)品，為公共衛(wèi)生防控事業(yè)添磚加瓦。

[1] 參考文獻(xiàn)：聯(lián)合國糧食及農(nóng)業(yè)組織、聯(lián)合國環(huán)境規(guī)劃署、世界衛(wèi)生組織等 “同一個(gè)健康” 聯(lián)合行動(dòng)計(jì)劃 (2022-2026 年): 共同促進(jìn)人類, 動(dòng)物, 植物和環(huán)境的健康[M]//“同一個(gè)健康” 聯(lián)合行動(dòng)計(jì)劃 (2022-2026 年): 共同促進(jìn)人類, 動(dòng)物, 植物和環(huán)境的健康. 2023.

構(gòu)建粵東公共衛(wèi)生防護(hù)網(wǎng)，三地聯(lián)合溯源登革病毒

猴痘、結(jié)核、鸚鵡熱、流感等多種病原微生物測序應(yīng)用

艾滋病毒近全長擴(kuò)增子分析，鑒定新的重組型

自然疫源性傳染病野外監(jiān)測、現(xiàn)場基因測序和分析

我們在行動(dòng)

簡潔模式

國內(nèi)首部動(dòng)物病原微生物mNGS專家共識(shí)！

加速高通量測序在獸醫(yī)領(lǐng)域普及

由中國獸醫(yī)協(xié)會(huì)獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室檢測分會(huì)牽頭起草的《動(dòng)物病原微生物宏基因組高通量測序技術(shù)規(guī)范專家共識(shí)（2024版）》正式發(fā)布，這是國內(nèi)首個(gè)獸醫(yī)領(lǐng)域宏基因組測序相關(guān)的指導(dǎo)性文件，華大智造參與共識(shí)編寫與征求意見稿討論，助力高通量測序技術(shù)在獸醫(yī)領(lǐng)域的應(yīng)用普及與規(guī)范化。共識(shí)整合了各方專家的意見和經(jīng)驗(yàn)，從獸醫(yī)領(lǐng)域應(yīng)用實(shí)踐出發(fā)，從實(shí)驗(yàn)室建設(shè)及管理、實(shí)驗(yàn)操作、生物信息學(xué)分析、結(jié)果判定、質(zhì)量控制和報(bào)告審核等方面詳細(xì)闡述了動(dòng)物病原微生物宏基因組測序的規(guī)范操作，有效促進(jìn)動(dòng)物病原微生物監(jiān)測與控制、維護(hù)公共衛(wèi)生安全，保障畜牧業(yè)健康發(fā)展，踐行“同一個(gè)健康”理念。

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南非醫(yī)學(xué)研究理事會(huì)

精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)高級項(xiàng)目經(jīng)理Rizwana Mia

在華大智造的設(shè)備支持下，南非醫(yī)學(xué)研究理事會(huì)基因組學(xué)中心于2019年在開普敦正式啟用，創(chuàng)立伊始，我們就同時(shí)啟動(dòng)了這個(gè)HIV宿主基因組項(xiàng)目。當(dāng)時(shí)，非洲還沒有真正的大規(guī)模高通量測序基礎(chǔ)設(shè)施。通過此次合作，華大智造不僅在我們的實(shí)驗(yàn)室建立了高通量測序平臺(tái)，并協(xié)助我們設(shè)計(jì)了實(shí)驗(yàn)室專門的規(guī)模化基礎(chǔ)設(shè)施，填補(bǔ)了我們在大規(guī)模平行測序技術(shù)方面的空白。更重要的是，通過擴(kuò)大實(shí)驗(yàn)室，我們希望能夠解決南非超負(fù)擔(dān)的醫(yī)療體系問題。我們的項(xiàng)目著眼于精英控制者，以揭示疾病進(jìn)展的機(jī)制以及宿主主導(dǎo)的先天免疫控制機(jī)制。此外，我們還納入了家庭組研究對象，以幫助我們更好地了解兒童HIV非進(jìn)展者與其同樣感染艾滋病毒的父母之間的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)可能有助于宿主免疫控制艾滋病毒的遺傳差異。

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