DNB 制備技術
DNB制備技術包括DNA 單鏈環化及DNB 制備。
DNA 單鏈環化：
是將帶有接頭序列的雙鏈DNA（Double- stranded DNA, dsDNA），通過高溫變性形成單鏈DNA（Single-stranded DNA, ssDNA），環化引物與SSDNA的兩端互補配對，在連接酶的催化下，SSDNA的首尾相連接，形成單鏈環狀DNA（Single-strand circular DNA, sscirDNA）。
DNB 制備：
以單鏈環狀DNA為模板，在DNA聚合酶作用下進行滾環擴增（Rolling Circle Amplification, RCA），將單鏈環狀DNA擴增到100-1000拷貝，擴增產物稱為DNB。DNB通過簡單的質量濃度質控后，就可以用于下一步的上機測序，操作簡單，且不需要昂貴的定量設備和耗材。
基于RCA的線性擴增技術，每次擴增都是以原始的DNA單鏈環為模板，使用保真性極高的聚合酶，使得在DNB的所有拷貝的同一個位置上出同樣的錯的幾率幾乎是零。RCA擴增技術有效的避免了PCR擴增錯誤指數積累的問題，從而大大提高測序的準確性。
規則陣列載片和DNB加載
規則陣列載片：
采用先進的半導體精密加工工藝，在載片表面形成結合位點陣列，實現DNB的規則排列吸附。所有活性位點間距保持整齊一致，每個位點只固定一個DNB，可保證不同納米球的光信號不會互相干擾，這不僅保證了測序準確度，而且提高了測序載片的利用效率，提供了極好的成像效率和最優的試劑用量。
DNB 加載：
DNB在酸性條件下帶負電，在表面活化劑的輔助下，通過正負電荷的相互作用，被加載到載片中有正電荷修飾的活化位點的過程，稱為DNB加載。DNB與載片上活化位點的直徑大小相當，盡可能避免了多個DNB 結合到同一個位點的情況，從而大大提高了DNB的有效利用率。
cPAS 技術
在DNA聚合酶的催化下，將測序引物錨定分子和熒光探針在DNB上進行聚合，洗脫掉未結合的探針后，在激光的作用下熒光信號被激發，隨后利用高分辨率成像系統對光信號進行采集、讀取和識別，從而獲得當前待測堿基的序列信息，然后加入再生洗脫試劑，去除熒光基團，進入下一個循環的檢測。華大智造優化了大量的反應條件，從上萬個酶突變體中篩選得到最優秀的測序酶，使生化反應時間可以縮短到1分鐘以內。
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二鏈測序
在完成一鏈測序后，加入具有鏈置換功能的DNA聚合酶進行DNA二鏈合成反應，在持續的延伸過程中，當遇到雙鏈結構的時候，在DNA聚合酶的解旋作用下，完成邊解旋邊復制的反應，形成大量的單鏈DNA作為二鏈測序的模板，然后雜交二鏈測序引物，開始二鏈的cPAS測序。利用DNA聚合酶的鏈置換特性，實現了DNB的雙端測序，而且重新合成的二鏈拷貝數更多，能夠獲得更強的熒光信號，有效的提高了測序的準確性。
堿基識別算法
旨在根據各個通道的光信號強度完成堿基識別并計算每個堿基的質量得分。通過對已有數據模型的訓練，建立信號的特征和測序錯誤的對應關系，在進行堿基識別的時候，根據每個堿基的信號特征輸出預估的錯誤率。 質量得分根據phred-33質量得分標準。
華大智造自主開發的Sub-pixel Registration算法，使圖像配準精確度達到了亞像素級別，大大提高了堿基識別的準確度。
此外，通過GPU加速的方法，在更高精度的算法條件下實現了200倍以上的加速，在提高識別準確率的同時實現了圖像處理和堿基識別的實時化，數據處理速度處于同行業領先水平。
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