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公共衛(wèi)生

高通量測序技術助力
公共衛(wèi)生的研究與應用

公共衛(wèi)生事件,主要包括傳染病疫情,群體性不明原因疾病,食品安全和職業(yè)危害,動物疫情,以及其他嚴重影響公眾健康和生命安全的事件。基因組學研究為流行病的預防監(jiān)測提供了重要的科學依據(jù),已成為公共衛(wèi)生工作者識別新發(fā)病原、監(jiān)測疫情變化的重要工具,同時也在病原微生物的耐藥機制研究以及疫苗研制等方面得到了廣泛的應用。

公共衛(wèi)生安全不僅關注人類健康,同時也聚焦動物、植物、環(huán)境乃至他們共同構成的生態(tài)間的交互關系。實現(xiàn)同一健康(One Health)理念需要通過跨學科的研究方法,而基因組學是實現(xiàn)這些的強大工具,幫助更好地從整體上理解生態(tài)系統(tǒng)中的健康狀況 [1]。

在公共衛(wèi)生領域,華大智造已形成病原微生物宏基因組測序、靶向測序、全基因組測序等應用場景的全流程產(chǎn)品組合。基于ATOPlex多重PCR建庫平臺,華大智造已推出可用于監(jiān)測新冠病毒、登革病毒1~4型、猴痘病毒、甲型/乙型流感病毒、HIV-1以及結核分枝桿菌等多款靶向測序全流程測序組合產(chǎn)品,為公共衛(wèi)生防控事業(yè)添磚加瓦。

[1] 參考文獻:聯(lián)合國糧食及農(nóng)業(yè)組織、聯(lián)合國環(huán)境規(guī)劃署、世界衛(wèi)生組織等 “同一個健康” 聯(lián)合行動計劃 (2022-2026 年): 共同促進人類, 動物, 植物和環(huán)境的健康[M]//“同一個健康” 聯(lián)合行動計劃 (2022-2026 年): 共同促進人類, 動物, 植物和環(huán)境的健康. 2023.

構建粵東公共衛(wèi)生防護網(wǎng),三地聯(lián)合溯源登革病毒

猴痘、結核、鸚鵡熱、流感等多種病原微生物測序應用

艾滋病毒近全長擴增子分析,鑒定新的重組型

自然疫源性傳染病野外監(jiān)測、現(xiàn)場基因測序和分析

我們在行動

簡潔模式

國內(nèi)首部動物病原微生物mNGS專家共識!

加速高通量測序在獸醫(yī)領域普及

由中國獸醫(yī)協(xié)會獸醫(yī)實驗室檢測分會牽頭起草的《動物病原微生物宏基因組高通量測序技術規(guī)范專家共識(2024版)》正式發(fā)布,這是國內(nèi)首個獸醫(yī)領域宏基因組測序相關的指導性文件,華大智造參與共識編寫與征求意見稿討論,助力高通量測序技術在獸醫(yī)領域的應用普及與規(guī)范化。共識整合了各方專家的意見和經(jīng)驗,從獸醫(yī)領域應用實踐出發(fā),從實驗室建設及管理、實驗操作、生物信息學分析、結果判定、質(zhì)量控制和報告審核等方面詳細闡述了動物病原微生物宏基因組測序的規(guī)范操作,有效促進動物病原微生物監(jiān)測與控制、維護公共衛(wèi)生安全,保障畜牧業(yè)健康發(fā)展,踐行“同一個健康”理念。

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南非醫(yī)學研究理事會

精準醫(yī)學高級項目經(jīng)理Rizwana Mia

在華大智造的設備支持下,南非醫(yī)學研究理事會基因組學中心于2019年在開普敦正式啟用,創(chuàng)立伊始,我們就同時啟動了這個HIV宿主基因組項目。當時,非洲還沒有真正的大規(guī)模高通量測序基礎設施。通過此次合作,華大智造不僅在我們的實驗室建立了高通量測序平臺,并協(xié)助我們設計了實驗室專門的規(guī)模化基礎設施,填補了我們在大規(guī)模平行測序技術方面的空白。更重要的是,通過擴大實驗室,我們希望能夠解決南非超負擔的醫(yī)療體系問題。我們的項目著眼于精英控制者,以揭示疾病進展的機制以及宿主主導的先天免疫控制機制。此外,我們還納入了家庭組研究對象,以幫助我們更好地了解兒童HIV非進展者與其同樣感染艾滋病毒的父母之間的關系,發(fā)現(xiàn)可能有助于宿主免疫控制艾滋病毒的遺傳差異。

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