2024年6月5日至7日，亞洲動植物基因組學大會 PAG Asia 2024在深圳大梅沙召開，本次大會專家云集，華大智造以 "What if genome sequencing technologies become a revolution in the field of agriculture？"為參會主題亮相現場，正式推出大規模農業基因組學Low-pass WGS全流程產品。
大規模農業基因組學Low-pass WGS全流程產品是一套專為農業科研和育種應用而開發的全流程組合產品，包括硬件、軟件和試劑，涵蓋“核酸提取-建庫-測序-生信分析”流程，配備靈活組合的自動化方案，可滿足不同的通量需求。通過全新的板式建庫試劑盒搭配Low-pass WGS技術，以高通量、低成本、靈活快捷、自動化友好為特點，能夠實現畜禽基因組的大規模測序與高效分析，為畜禽遺傳改良和分子育種提供了強有力的工具支撐。
相較于傳統芯片分型，這款組合產品無需提前篩選育種相關信息位點、無需定制個性化芯片、無需最低訂購量，以幾乎相同的成本即可獲得接近全基因組范疇位點數據，助力育種計算模型的升級迭代，大幅提升育種值測算準確率。同時，用戶可選擇非標定制方案，廣大農業基因組學專家對不同物種、不同通量、不同交付時效的需求，都可以通過這套組合產品的靈活方案來完成。
當前，華大智造推出的農業基因組學大規模Low-pass WGS全流程組合產品包括標準版和基礎版兩個版本，其中標準版基于高通量基因測序儀DNBSEQ-T7（年樣本量在100k-1000k），基礎版基于中高通量基因測序儀MGISEQ-2000（年樣本量10K-50K)。
基于MGISEQ-2000打造的中通量全流程方案 (192樣本/天)，均一化和制備DNB共用同一臺MGISP-100
基于DNBSEQ-T7打造的高通量全流程方案 (1536樣本/天)
高通量Low-pass WGS全流程組合產品
有哪些“秘密武器”？
01無需純化，建庫僅需3步
傳統的PCR-FREE建庫過程需要經歷打斷、純化、連接反應、純化、定量、均一化/pooling過程。華大智造在這套全流程組合產品中全新推出的MGIEasy Large-scale PCR-FREE 全基因組低深度文庫制備模塊（板式）試劑盒專為Low-pass WGS應用而設計, 僅需三步（打斷、連接反應、等體積pooling），即可實現無純化建庫過程，大大縮短大規模建庫中所需的時間。
02全流程高度自動化
華大智造自研的實驗室自動化平臺，Low-pass WGS組合產品突破了大規模建庫通量的限制，能夠以最少的自動化設備靈活匹配超高通量的實驗室需求，從而在短時間內低成本、高度自動化地完成大規模提取、建庫、均一化和Pooling，最多只需要5臺自動化設備就能滿足DNBSEQ-T7的滿通量運行的需求。
03通量靈活，效率領先
該組合產品基于DNBSEQ-T7標準版方案，日通量可達1536個樣本，周通量7680個樣本，年通量可達38.4萬個樣本；基于MGISEQ-2000中通量方案日通量可達192個樣本，周通量480個樣本，年通量為2.4萬個樣本（以豬的1x測序深度為例，單個樣本數據量為3G，以一周6天，每年50周計算）。
04簡易操作，極速享受
組合方案中使用華大智造自主研發的生物信息分析加速器和自研Low-pass WGS分析加速軟件，其中MegaBOLT可以處理192 個樣本/24 h，ZBOLT Pro可以處理1536 個樣本/24 h，其SNP位點信息與微陣列/50x WGS分析結果的一致性高達98%（以豬的1x測序深度為例）。
目前，華大智造推出的農業大規模Low-pass WGS全流程產品已提供部分物種的參考基因組集合，用戶無需自行構建數據庫即可進行豬的基因分型, 還可為已擁有豬參考基因組集合的用戶提供免費格式轉換服務。
組學專家齊聚，共話學術前沿
在6月6日和7日的兩場專業論壇上，來自產業界的組學服務商代表和學術界的組學專家對業內組學技術的應用展開了充分的探討。
博瑞迪應用科學家周靖航博士、華智生物分子育種技術智創中心總監唐順學博士強調了DNBSEQ平臺在基因組學研究和農業育種中的重要作用。周靖航博士分享了GBTS技術與DNBSEQ平臺結合在基因分型方面的卓越性能，在動植物品種鑒定、功能基因檢測、全基因組選擇等應用方向上具有出色表現。唐順學博士則強調了DNBSEQ平臺在推動生物技術(BT)、數據技術(DT)和人工智能(AI)方向融合驅動育種工作中的關鍵作用，可為智能和精準農業育種提供強有力的支持。
來自中國農業大學的胡曉湘教授，聯邦水產與漁業研究所的Mugue教授以及西北農林科技大學的姜雨教授、澳大利亞阿德萊德大學Lloyd Low等人共同強調了 DNBSEQ 平臺在動物育種領域的應用。胡曉湘教授突出了大規模平行測序技術在豬和其他畜禽基因組選擇中的重要作用，指出了其在加速優良遺傳特性識別和推動產業可持續發展方面的貢獻。
Mugue 教授強調了DNBSEQ平臺在虹鱒和三文魚基因組研究中的重要作用，對這些魚類基因組的深入研究，可以使科學家們能夠識別出與生長速度、抗病性和適應性等重要經濟性狀相關的基因標記，進而指導育種計劃，提高養殖效率和產品質量；姜雨教授表示基于機器學習算法的荷斯坦牛繁殖性狀基因組選擇方法搭配DNBSEQ平臺，能夠深入挖掘大規模測序數據下的基因與性狀的復雜關聯，為精準預測基因組估計育種值（GEBV）提供新的途徑。Lloyd Low展示了low-pass WGS以及TCS 70K panel 搭配DNBSEQ平臺對牛基因組進行分析的成功案例，并表示有望拓展到其他更多物種。
針對本次重磅推出的農業基因組學 Low-pass WGS 全流程組合產品，胡曉湘教授表示，“所測即所得，所得即所用，華大智造測序平臺和 Low-pass WGS 應用結合，將助力農業動物育種大模型，提升育種效率。”
此外，與會專家指出：“利用DNBSEQ平臺進行全基因組測序，我們成功識別了影響肉雞母系生產性能的關鍵SNP位點。這一發現不僅優化了基因組選擇和全基因組關聯分析的策略，而且，隨著DNBSEQ-T7測序儀的引入，大規模基因組學研究的成本也得到了有效降低。”
華大智造產品市場中心胡豆博士參加工業論壇
參會人員合影
結語
PAG Asia 2024作為一場專注于動植物基因組學研究的國際性盛會，成功匯聚了全球動植物基因組學領域的專家學者，提供了一個交流最新科研成果和技術創新的絕佳平臺。
華大智造全新推出的農業高通量Low-pass WGS全流程組合產品，旨在解決全球人口增長、氣候變化和環境壓力下的農業挑戰。通過降低測序成本和技術創新，為農業領域提供從核酸提取到數據分析的全流程組合產品，縮短育種周期，提升育種效率，促進農民、育種者和研究人員培育性能優越的品種，減少資源消耗，促進農業的可持續發展。
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