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Q1:DNBSEQ-E25有什么獨特亮點?

DNBSEQ-E25,小巧、簡單、快捷,使用0門檻:

?小巧:0.1平方米;無需潔凈間;無特殊環境要求。

?簡單:開箱即用;無需光路調校;易維護。

?快捷:10分鐘準備時間;5~8小時測序。


Q2:DNBSEQ-E25占地面積?

DNBSEQ-E25儀器占桌面積僅0.1㎡。


Q3:DNBSEQ-E25適配哪些應用?

主推應用包括病原快檢、小型全基因組測序、靶向測序、教育培訓等方向。


Q4:DNBSEQ-E25的最大產能?

DNBSEQ-E25最大產能為7.5GB。


Q5:DNBSEQ-E25最快輸出下機數據的時間?

DNBSEQ-E25最快5小時左右就可以輸出下機數據(SE100測序讀長),對特殊樣本的緊急測序需求能夠給予即時響應,適用于突發公共衛生事件處理等應用場景。


Q6:DNBSEQ-E25的最小讀長和最大讀長?

DNBSEQ-E25最小讀長為SE35,最大讀長為PE150。您也可以在儀器操作界面自定義讀長,如SE75、PE100等。


Q7:DNBSEQ-E25在最大讀長以外是否還支持自定義讀長?

支持,操作者可以在儀器界面輸入所需讀長,例如可使用SE100耗材運行SE35、SE50、SE75等讀長的測序,亦可使用PE150耗材運行PE100測序,或雙端不等長的測序應用,如Read1: 60bp+Read2: 30bp。


Q8:DNBSEQ-E25有幾種機型?

DNBSEQ-E25有2種配置,包括:標準機型(DNBSEQ-E25RS)可高效處理主機采集的原始數據,輸出標準格式的FASTQ數據;擴展機型(DNBSEQ-E25ARS)在標準機型的基礎上,可以集成生信流程,實現測序與分析合二為一。


Q9:DNBSEQ-E25測序儀適配華大智造的實驗室管理系統嗎?

與華大智造其他測序儀產品類似,DNBSEQ-E25測序儀可以通過Zlims系統,實現測序數據自動傳輸。亦可通過Zlims系統調度生信分析。


Q10:DNBSEQ-E25在生化原理上與其他DNBSEQ平臺有何異同?

DNBSEQ-E25在生化原理上與其他DNBSEQ平臺的異同如下:

(1)相同:DNBSEQ-E25采用華大智造獨有的 DNBSEQ?測序技術,包括滾環擴增生成 DNA 納米球(DNB),規則陣列載片和 cPAS 聯合探針錨定聚合測序法,具有測序準確度高,重復序列率低,標簽跳躍少的特點。

(2)不同:

①流體:DNBSEQ-E25采用微流控技術,將傳統測序儀中的液路流道集成在一次性芯片中,節省試劑消耗量,廢液測試后隨耗材拋棄,操作簡單,儀器內部無液體接觸,無需日常清洗與維護,大幅提高測序儀的可靠度。

②檢測:DNBSEQ-E25采用CMOS傳感器直接從DNB陣列同時讀取DNA序列信息,無需依賴傳統光學系統,大幅縮短測序時間。

③化學:DNBSEQ-E25采用改良版的cPAS聯合探針錨定聚合測序法,加速生化反應速率,進一步縮短測序時長。


Q11:DNBSEQ-E25試劑盒是否支持單、雙Barcode測序?

都支持,所有型號的測序耗材都已預裝Barcode測序(或雙Barcode測序,至多20bp)所需條形碼引物、測序試劑等,無需額外補充任何試劑。這也是SE100、PE150測序耗材的規格為120Cycles,320Cycles的原因。


Q12:DNBSEQ-E25參數內時間均不包含標簽測序時間,如果測Barcode,額外需要多少時間?

取決于標簽讀長(8bp或10bp),單Barcode測序將會需要額外的35-40分鐘,雙Barcode測序將會需要額外的60-70分鐘。


Q13:DNBSEQ-E25測序試劑盒在制備DNB流程上與其他平臺有何異同?

DNBSEQ-E25默認適配一步法制備DNB,由線性文庫(dsDNA,如PCR產物、連接產物等)直接制備DNB,相較于單鏈環化再制備DNB的兩步法,建庫及制備DNB時間可得到進一步壓縮。如此設計主要考慮到E序列主打快速測序,需要盡可能壓縮建庫、測序流程時間,同時也考慮DNBelab-D4數字化樣本制備系統與DNBSEQ-E25測序儀的適配問題。


Q14:如何維護DNBSEQ-E25?

DNBSEQ-E25測序儀由于采用微流控測序載片與集成式試劑盒的設計,常態化運行情況下無需進行額外水洗等操作。我們建議您至少以每月一次的頻率,在E25開機狀態下,用棉球蘸75%酒精擦拭E25載片托架,并確保該載片托架上無液體及結晶殘留即可。


Q15:如果我需要打包DNBSEQ-E25運輸到另一個實驗場地,要如何操作?

在打包之前,請在儀器界面選擇計算模塊關機關閉計算模塊,再將運輸專用載片置于載臺,在儀器界面選擇“打包關機”,儀器將會自動運行,復位至打包位置。當測序儀主機界面出現可以關閉電源界面時,關閉測序儀主機電源。隨后將測序儀主機、計算模塊、電源適配器、電源線等依次打包即可。


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