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MGISEQ-2000
建庫試劑
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MGISEQ-2000RS FluoXpert是一款融合高通量測序技術(MPS)和多重免疫熒光技術(mIF)的多功能一體機,只需通過軟件切換即可實現測序與染色的功能轉換。FluoXpert在MGISEQ-2000RS硬件基礎上進行軟件升級,配套高效穩定的多重免疫熒光試劑套裝,可在單個組織切片上檢測多個目標蛋白并保留空間信息,與基因測序形成技術互補,為腫瘤免疫微環境提供更準確、更全面、更高效的評估依據,助力病理研究。
MGISEQ-2000RS FluoXpert是一臺集基因測序和多重免疫熒光染色的多功能機型;配備測序軟件和FluoXpert多重免疫熒光染拍軟件,通過軟件切換實現功能切換。用戶可根據需要選購配套的FluoXpert多重免疫熒光試劑套裝,和多重免疫熒光圖像分析平臺FluoXpert Vision。
MGISEQ-2000RS FluoXpert樣本兼容性高,支持新鮮冰凍組織或FFPE樣本上機;兼容市售抗體,無需過多的預處理,染色、拍照全自動完成,可以在一張組織切片上檢測多種生物標志物的表達水平并保留空間信息。與配套的FluoXpert多重免疫熒光試劑套裝搭配使用,MGISEQ-2000RS FluoXpert支持3-24種標志物(marker)的檢出,可廣泛應用于腫瘤分型、預后評估、腫瘤微環境、神經科學、轉化醫學研究等。基于染拍一體化、系統化和模塊化的設計理念,MGISEQ-2000RS FluoXpert的上機流程更加便捷快速。而且,在配套的FluoXpert多重免疫熒光試劑套裝中,集成了自發熒光去除試劑,簡化了上機前樣本處理步驟;節省抗體用量,較傳統手動免疫組化檢測,MGISEQ-2000RS FluoXpert的抗體用量可降低約2.5-5倍,有效節約試劑成本。MGISEQ-2000RS FluoXpert的操作穩定性高,上機染色效果與金標準IHC染色效果無顯著性差異,優化的拼接算法及成像技術可以實現亞細胞水平分辨率的全景成像效果。
MGISEQ-2000RS FluoXpert的多重染色功能與其測序功能互不影響、互為補充。與常規的蛋白染拍一體機相比,MGISEQ-2000RS FluoXpert的測序數據可以為染拍結果提供一步到位的分子檢測數據作為補充或參考;與常規的基因測序儀相比,MGISEQ-2000RS FluoXpert的測序性能優越,支持多種測序讀長,通量靈活(55Gb-1440Gb),支持不同規格的測序載片獨立運行,能全面滿足廣泛的測序需求,是國內外測序實驗室的首選機型之一。
已購置MGISEQ-2000RS的用戶僅需訂購【多組學升級包】即可,無需重新購機。多組學升級包的構成是:多重免疫熒光染拍軟件和多重免疫熒光圖像分析平臺FluoXpert Vision(選配)。
配套的FluoXpert多重免疫熒光試劑套裝用戶可根據實驗需要,按需購買。目前,MGISEQ-2000RS FluoXpert的配套試劑提供2個版本:標準版(6-plex,24-plex)和定制版(因項目需求而異,可在3-24plex范圍內進行選擇)。
FluoXpert多重免疫熒光試劑套裝(標準版)包括:多重免疫熒光試劑盒,以及FluoXpert染色載片。考慮到不同尺寸切片樣本的染拍需要,MGISEQ-2000RS FluoXpert提供三種可選的載片規格,包括:
-SS(Solo Small,適用于小切片):適合小塊組織切片,如穿刺小組織,速度更快。
-SL(Solo Large,適用于大切片):適合大塊組織切片,如扁桃體,大腫瘤,面積、視野更大。
-DL(Dual Large,適用于雙切片共染):一個載片可貼兩塊切片,適合批量染色,節省試劑和時間。
以標準版試劑盒(6-plex)為例,MGISEQ-2000RS FluoXpert完成6標7色染拍工作需要進行3輪抗體染色和1輪核染色(每循環單染色載片可完成2個標志物進行計算),總共4個循環,總用時約4小時。最佳通量的計算是按照一周5個工作日,每天8小時工作時間進行計算,即:每個工作日可以完成2次上機運行且每次運行2張染色芯片,雙載物臺可同時或滾動上機,每周工作時間可完成2*2*5=20張切片(SS/SL載片),4*2*5=40張切片(DL載片)。
FluoXpert下機數據為拼接完成的全景掃描圖像。該圖像會對連續的組織區域進行裁剪(可選)并可根據需求輸出不同的壓縮格式(OME-TIFF,TIFF,JPEG,PNG,BMP)。
FluoXpert Vision分析平臺可以提供圖片的可視化及標注,根據標志物閾值進行陽性細胞數定量分析,根據多標志物表達情況進行細胞表型分析,以及鄰近細胞群空間位置分析。
目前儀器無法兼容測序和免疫熒光軟件同時啟動。需將一方完全關閉后才能啟動另外一個軟件。
SS染色載片的掃描面積為15mm*15mm,SL染色載片的掃描面積為15mm*20mm,DL染色載片的掃描面積為15mm*20mm*2。
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