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MGISEQ-2000
建庫試劑
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DNBelab-D4 可完成酶切打斷、接頭連接、PCR、磁珠純化、片段篩選、核酸定量、DNB制備等建庫步驟。用戶在 DNBelab-D4 上投入核酸(DNA和/或RNA),中間所有建庫步驟全自動完成后,隨后取出建庫產物(雙鏈DNA文庫或DNB),同時 DNBelab-D4 給出建庫產物濃度和建議投入量。
DNBelab-D4 一次運行1張樣本制備卡,1張樣本制備卡有4個通道,通常支持至多4個樣本/運行的建庫流程。
在完成手工加封閉液、建庫試劑和樣本(預計耗時15分鐘內)并將樣本制備卡放入DNBelab-D4(以下簡稱為D4) 后,D4開始自動運行建庫流程。
D4的運行時長視建庫方案有所不同,以DNBelab-D4RS 酶切DNA文庫制備試劑套裝V2.0(940-001198-00)為例,該試劑套裝的建庫方案為包含PCR的通用建庫流程(包含酶切打斷、末端修復、加A尾、磁珠純化、接頭連接、磁珠純化、PCR、磁珠純化、DNB制備,DNB定量),可應用于簡單基因組組裝、mNGS等應用,D4運行時長為3小時20分鐘(包含內置自動定量)。
通常,針對相同的建庫方案,D4的運行時長不會長于手工建庫時長。
Q4:DNBelab-D4 是否含有定量功能?
DNBelab-D4 內置定量模塊,采用熒光染料,可全自動地完成雙鏈DNA文庫定量或DNB定量,在結果頁面給出核酸濃度的結果。
采用 DNBelab-D4(以下簡稱為D4)的標準建庫試劑盒,用戶需在樣本制備卡上手工加封閉液、建庫試劑和樣本,預計耗時在15分鐘內。隨后將樣本制備卡放入D4,后續所有建庫步驟均由D4自動完成,在D4結果頁面顯示各通道的建庫產物定量結果。將樣本制備卡從儀器中取出,用戶需手工將建庫產物從樣本制備卡中取出并去除封閉液。隨后可根據測序要求進行文庫混合。
DNBelab-D4 采用獨特的全封閉體系,在建庫過程中所有液滴始終被封閉液包裹,包括實驗過程中產生的所有廢液也被封閉液包裹并保留在樣本制備卡上,與外界空氣完全隔離,相當于全流程“無開蓋”。各反應體系之間相互獨立,從而完全避免了氣溶膠產生,杜絕外源污染和樣本交叉串擾。目前已在 mNGS、tNGS、腫瘤小panel 等測序應用進行交叉污染驗證,結果均表明 DNBelab-D4 在建庫流程可實現“零污染建庫”。
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